細胞自噬的研究方法介紹

一、自噬誘導劑  

(1) Bredeldin A / Thapsigargin / Tunicamycin ：模擬內質(zhì)網(wǎng)應激

(2) Carbamazepine/ L-690，330/ Lithium Chloride（氯化鋰）：IMPase抑制劑（即Inositol monophosphatase，肌醇單磷酸酶）

(3) Earle's平衡鹽溶液：制造饑餓

(4) N-Acetyl-D-sphingosine（C2-ceramide）：Class I PI3K Pathway抑制劑

(5) Rapamycin：mTOR抑制劑

(6) Xestospongin B/C：IP3R阻滯劑

二、自噬抑制劑  

(1) 3-Methyladenine（3-MA）：（Class III PI3K） hVps34 抑制劑

(2) Bafilomycin A1：質(zhì)子泵抑制劑

(3) Hydroxychloroquine（羥氯喹）：Lysosomal lumen alkalizer（溶酶體腔堿化劑）

除了選用上述工具藥外，一般還需結合遺傳學(xué)技術(shù)對自噬相關(guān)基因進(jìn)行干預：包括反義RNA干擾技術(shù)（Knockdown）、突變株篩選、外源基因導入等。

三、自噬過(guò)程進(jìn)行觀(guān)察和檢測 

細胞經(jīng)誘導或抑制后，需對自噬過(guò)程進(jìn)行觀(guān)察和檢測，常用的策略和技術(shù)有：

1、觀(guān)察自噬體的形成

由于自噬體屬于亞細胞結構，普通光鏡下看不到，因此，直接觀(guān)察自噬體需在透射電鏡下。phagophore的特征為：新月?tīng)罨虮瓲?，雙層或多層膜，有包繞胞漿成分的趨勢。自噬體（**1）的特征為：雙層或多層膜的液泡狀結構，內含胞漿成分，如線(xiàn)粒體、內質(zhì)網(wǎng)、核糖體等。自噬溶酶體（**2）的特征為：?jiǎn)螌幽?，胞漿成分已降解。（autophagic vacuole，**）

2、在熒光顯微鏡下采用GFP-LC3融合蛋白來(lái)示蹤自噬形成

由于電鏡耗時(shí)長(cháng)，不利于監測（Monitoring）自噬形成，人們利用LC3在自噬形成過(guò)程中發(fā)生聚集的現象開(kāi)發(fā)出了此技術(shù)。無(wú)自噬時(shí)，GFP-LC3融合蛋白彌散在胞漿中；自噬形成時(shí)，GFP-LC3融合蛋白轉位至自噬體膜，在熒光顯微鏡下形成多個(gè)明亮的綠色熒光斑點(diǎn)，一個(gè)斑點(diǎn)相當于一個(gè)自噬體，可以通過(guò)計數來(lái)評價(jià)自噬活性的高低。

3、利用Western Blot檢測LC3-II/I比值的變化以評價(jià)自噬形成

自噬形成時(shí)，胞漿型LC3（即LC3-I）會(huì )酶解掉一小段多肽，轉變?yōu)椋ㄗ允审w）膜型（即LC3-II），因此，LC3-II/I比值的大小可估計自噬水平的高低。

（注意：LC3抗體對LC3-II有更高的親和力，會(huì )造成假陽(yáng)性。方法2和3需結合使用，同時(shí)需考慮溶酶體活性的影響。）

4、檢測長(cháng)壽蛋白的批量降解：非特異

5、MDC（Monodansylcadaverine，單丹磺酰尸胺）染色：包括自噬體，所有酸性液泡都被染色，故屬于非特異性的。

6、CellTrackerTM Green染色：主要用于雙染色，但其能染所有的液泡，故也屬于非特異性的。

四、自噬相關(guān)蛋白的定位 

在研究自噬相關(guān)蛋白時(shí)，需對其進(jìn)行定位。由于自噬體與溶酶體、線(xiàn)粒體、內質(zhì)網(wǎng)、高爾基體關(guān)系密切，為了區別，常用到一些示蹤蛋白在熒光顯微鏡下來(lái)共定位：

Lamp-2：溶酶體膜蛋白，可用于監測自噬體與溶酶體融合。

LysoTrackerTM 探針：有紅或藍色可選，顯示所有酸性液泡。

pDsRed2-mito：載體，轉染后表達一個(gè)融合蛋白（紅色熒光蛋白+線(xiàn)粒體基質(zhì)定位信號），可用來(lái)檢測線(xiàn)粒體被自噬掉的程度（Mitophagy）。

MitoTraker探針：特異性顯示活的線(xiàn)粒體，熒光在經(jīng)過(guò)固定后還能保留。

Hsp60：定位與線(xiàn)粒體基質(zhì)，細胞死亡時(shí)不會(huì )被釋放。

Calreticulin（鈣網(wǎng)織蛋白）：內質(zhì)網(wǎng)腔

（注意：這些蛋白均為胞漿蛋白，爬片或胰酶消化的細胞在做免疫熒光前需先透膜（permeablize），可采用0.1%SDS處理。）