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如何看懂流式結果圖

更新時(shí)間:2019-08-30      點(diǎn)擊次數:12178

流式結果圖有4種類(lèi)型,分別為:1. 直方圖  2.散點(diǎn)圖  3. 等高線(xiàn)圖  4.密度圖

下面一一為大家介紹

1. 直方圖(Histograms)

a.橫坐標代表熒光信號或散射光信號相對強度,可以是線(xiàn)性或對數坐標。

 

 

 

 

 

b.縱坐標一般是相對細胞數。

直方圖適用于分析處理周期(如下圖)

 

 

直方圖分析數據注意事項:

① 不能比較不同標記之間的表達量。如一號樣本單標記CD133、二號樣本單標記CD44,那么CD133與CD44表達量不能用直方圖進(jìn)行比較。

② 直方圖的形狀(直方圖的高度及寬度)取決于儀器的類(lèi)型、處理軟件和樣本

③檢測目的細胞非常少(即檢測的細胞在一個(gè)細胞群體中所占的比例特別少),因此需要統計大量的數據,直方圖將會(huì )將該稀有細胞覆蓋,如下圖散點(diǎn)圖中的P2門(mén)為CD16陰性群體,但在直方圖中則幾乎看不出來(lái),所以此時(shí)散點(diǎn)圖為展示數據方式。

 

 

2. 散點(diǎn)圖(Dot plots)

散點(diǎn)圖是雙變量圖的基本圖形,相對于單參數直方圖其分析通量更高,同時(shí)也能更好觀(guān)察到較小比例細胞群,參見(jiàn)直方圖注意事項2,另外散點(diǎn)圖中設門(mén)后,可以賦予門(mén)控顏色,便于觀(guān)察門(mén)控細胞群在其他圖中的分布,比如下圖只賦予淋巴細胞門(mén)紅色,則可以觀(guān)察到淋巴細胞中在散射光圖中的分布。

 

 

 

 

 

橫坐標和縱坐標都是光信號,十字門(mén)左下角是雙陰性群,右下角和左上角是單陽(yáng)群,右上角是雙陽(yáng)群。散點(diǎn)圖上的每一個(gè)點(diǎn)可以代表某一個(gè)細胞的信息。

 

但是散點(diǎn)圖在顯示足夠多events下的細胞分群上缺乏細節,如下圖,流式儀器記錄的events達到50000以上時(shí),CCR7的陽(yáng)性群與陰性群已經(jīng)沒(méi)有明顯界限,但當用等高線(xiàn)圖或者密度圖時(shí),明顯改善點(diǎn)圖存在的缺點(diǎn)。

 

3.密度圖(Density plot)

密度圖不僅能夠表示一個(gè)標記的表達水平,還能顯示給定區域中事件的相對數量(密度)。有三種密度圖。密度度、斑馬線(xiàn)圖、偽彩圖。選擇自己一種喜歡的應用

 

 

 

 

4.等高線(xiàn)圖(Contour plots)

等高線(xiàn)圖是另一顯示數據密度的形式。該圖使用等高線(xiàn)顯示數據的相對強度。等高線(xiàn)的每條線(xiàn)包含events的百分比由所用軟件的等高線(xiàn)圖決定。單純的等高線(xiàn)圖不能顯示低密度的群體顆?;蛘弋惓V?,比較好的策略為等高線(xiàn)圖與點(diǎn)圖結合起來(lái)使用,比如下圖左邊為點(diǎn)圖,中間為等高線(xiàn)圖,左邊為等高線(xiàn)加點(diǎn)圖。

 

 

 

 

分析,建議用散點(diǎn)圖用直方圖不能說(shuō)錯,但這需要在沒(méi)有自發(fā)熒光或自發(fā)熒光低、熒光滲漏調整到位的情況下。而在實(shí)際檢測中,自發(fā)熒光總是難以避免,更不用說(shuō)現在多色流式中熒光滲漏對通道的干擾。

通過(guò)下面這個(gè)圖可以明顯看出,在直方圖上,自發(fā)熒光造成的拖尾,使得你的陰陽(yáng)性分界位置難以確定,即使GFP樣本能夠形成雙峰,但實(shí)際上雙峰分界位置同時(shí)包括了自發(fā)熒光假陽(yáng)性信號、陽(yáng)性群弱表達信號,這兩部分信號數量一樣的時(shí)候,這個(gè)位置恰好相互抵消,但如果不一樣的,這個(gè)比例就不準確了,如果改用下面的散點(diǎn)圖,用不規則門(mén)(如下面的梯形門(mén)),就可以準確圈出陽(yáng)性群,呈現更真實(shí)的比例:

 

綜上,不同類(lèi)型的流式圖各有優(yōu)缺點(diǎn),適用于不同類(lèi)型的檢測。

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